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人 EGFR/KRAS/BRAF/ERBB2/PIK3CA 基因突变检测试剂盒体外诊断试剂产品注册技术审评报告(2026年版)

发布时间:2026-04-08  

一、产品概述

  (一)产品主要组成成分

人 EGFR/KRAS/BRAF/ERBB2/PIK3CA 基因突变检测试剂盒体外诊断试剂产品注册技术审评报告(2026年版)(图1)

  本试剂盒由试剂盒1和试剂盒2 组成,详见表1。

  表1 试剂盒组成

编号

组分名称

主要成分

规格

数量

试剂盒1

多重PCR缓冲液

三羟甲基氨基甲烷盐酸盐、氯

化钾、水

180μL/管

1

dNTP混合物

水、核糖核苷酸

10μL/管

1

氯化镁缓冲液

氯化镁、水

75μL/管

1

多重PCR酶

DNA聚合酶

75μL/管

1

UNG酶

UNG酶

45μL/管

1

PCR引物混合物

寡核苷酸

215μL/管

1

虾碱酶缓冲液

水、氯化镁缓冲液、三羟甲基

氨基甲烷盐酸盐

60μL/管

1

虾碱酶

虾碱性磷酸酶、甘油

110μL/管

1

延伸缓冲液

水、硫酸镁、氯化钾、三羟甲基氨基甲烷盐酸盐

55μL/管

1

延伸酶

高特异性扩增聚合酶

12μL/管

1

仪器校准品

寡核苷酸

80μL/管

1

均一化质控品

寡核苷酸

145μL/管

1

延伸引物混合物1

寡核苷酸,突变类型:

EGFRp.D770_N771insSVD、

38μL/管

1

   

EGFRp.E746_T751>A、

EGFRp.C797S

(COSM6493937)、

EGFRp.E746_A750del

(COSM6223)、

EGFRp.L861Q、

EGFRp.L747_P753>S、

EGFRp.L747_T751del

   

延伸引物混合物2

寡核苷酸,突变类型为:

EGFRp.G719A、

EGFRp.V769_D770insASV、

EGFRp.C797S

(COSM5945664)、

EGFRp.E746_A750del

(COSM6225)、

KRASp.G12S、

KRASp.G12R、

KRASp.G12C、PIK3CAp.E545K

38μL/管

1

延伸引物混合物3

寡核苷酸,突变类型为:EGFRp.T790M、

EGFRp.G719S、

EGFRp.G719C、

EGFRp.D770_N771insG、

EGFRp.E746_A750del

(COSM6223)、

EGFRp.H773_V774insH、

ERBB2 p.G776>VC、

38μL/管

1

   

ERBB2 p.A775_G776insYVMA(COSM12558)、

KRASp.G12A、

KRASp.G12D、

KRASp.G12V

   

延伸引物混合物4

寡核苷酸,突变类型为:

BRAFp.V600E、

EGFRp.L747_S752del、

EGFRp.L747_E749del、

EGFRp.E746_T751>A、

EGFRp.L858R、

ERBB2 p.A775_G776insYVMA

(COSM20959)、

KRASp.G13D、

PIK3CAp.E542K、

PIK3CAp.H1047R

38μL/管

1

延伸终止混合液1

水、乙酰化核糖核苷酸

8μL/管

1

延伸终止混合液2

水、乙酰化核糖核苷酸

8μL/管

1

延伸终止混合液3

水、乙酰化核糖核苷酸

8μL/管

1

延伸终止混合液4

水、乙酰化核糖核苷酸

8μL/管

1

2

水(HPLC级)

HPLC级水

11mL/瓶

1

阳性质控品

细胞系DNA

3μL/管

1

阴性质控品

细胞系DNA

3μL/管

1

  (二)产品预期用途

  本试剂盒用于体外定性检测非小细胞肺癌(NSCLC)、结直肠癌(CRC)患者经福尔马林固定的石蜡包埋(FFPE)组织样本中EGFR、KRAS、PIK3CA、BRAF和ERBB2 基因变异。针对NSCLC,EGFR基因19号外显子缺失(19del)和L858R点突变用于盐酸厄洛替尼片和甲磺酸奥希替尼片的伴随诊断检测,EGFR基因T790M点突变用于甲磺酸奥希替尼片的伴随诊断。针对CRC,KRAS基因野生型用于西妥昔单抗注射液的伴随诊断检测。

  本试剂盒所能检测的其他基因突变位点未经伴随诊断验证。

  表1:伴随诊断用途的基因变异类型及相应的靶向药物

靶向药物

基因及氨基酸突变类型

癌种

盐酸厄洛替尼片

EGFR:19del、L858R

非小细胞肺癌

甲磺酸奥希替尼片

EGFR:19del、L858R、T790M

西妥昔单抗注射液

KRAS野生型

结直肠癌

  下表 2 中为本试剂盒可以检出,但未经伴随诊断验证的基因变异类型。

  表2 未经伴随诊断验证的基因变异类型

基因

氨基酸突变类型

癌种

EGFR

D770_N771insSVD、

D770_N771insG、H773_V774insH、

V769_D770insASV、C797S、G719X、

L861Q

非小细胞肺癌

ERBB2

A775_G776insYVMA、G776>VC

非小细胞肺癌

KRAS

G12A、G12V、G12D、G12C、G12S、

G12R、G13D

非小细胞肺癌

PIK3CA

H1047R、E542K、E545K

非小细胞肺癌、结直肠癌

BRAF

V600E

非小细胞肺癌、结直肠癌

  本试剂盒仅用于对NSCLC和CRC患者靶基因序列的检测,其检测结果仅供临床参考,不应作为患者个体化治疗的唯一依据,临床医生应结合患者病情及其他实验室检测指标等因素对检测结果进行综合判断。

  (三)产品包装规格

  32测试/盒。

  (四)产品检验原理

  本试剂盒以 FFPE样本中提取的DNA为待测物,针对EGFR/BRAF/KRAS/ERBB2/PIK3CA5 个基因的多种点突变、插入、缺失等设计特异性延伸引物,完成单碱基延伸反应后在飞行时间质谱检测系统中进行检测。

  飞行时间质谱检测系统(型号:MassARRAYDx)基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术(MatrixAssistedLaser Desorption/Ionization-TimeofFlight,MALDI-TOF),其原理是将待测 DNA进行 PCR扩增,所得PCR扩增产物用虾碱酶(Shrimp Alkaline Phosphatase,SAP)纯化去除未结合的dNTPs,然后利用PCR对扩增产物进行单碱基延伸,应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术对延伸产物进行检测,通过区分飞行时间长短来进行数据分析。最后通过计算机软件分析判断目标区域序列是否发生改变。

二、临床前研究概述

  (一)主要原材料

  1.主要原材料的选择

  主要原材料包括 PCR引物、单碱基延伸引物、UNG酶、dNTP混合物、多重PCR酶、虾碱酶、延伸酶和质控品。

  PCR引物、单碱基延伸引物为自行设计后委托专业的合成公司合成,其余主要原材料通过功能性试验筛选出最佳原材料和供应商,制定了各主要原材料质量要求并经检验合格。

  2.企业参考品和质控品的设置情况

  企业参考品包括:阴性参考品、阳性参考品、重复性参考品和检测限参考品。

  其中阴性参考品 1份,检测范围内所有靶基因变异位点均无突变的样本;阳性参考品30 份,包含检测范围内所有变异位点;重复性参考品 2份,包含检测范围内各靶基因代表性变异位点;检测限参考品10 份,包含检测范围内所有靶基因变异位点检测限突变频率的样本。

  试剂盒包含 1份阳性质控品和 1份阴性质控品,用于检测过程的质量控制。

  (二)生产工艺及反应体系研究

  根据试剂盒中试剂及组分的主要生产工艺的研究结果,确定了最佳的生产工艺。

  对产品反应体系的研究包括DNA样本用量、多重 PCR引物浓度、多重PCR酶浓度、SAP酶浓度、多重PCR退火温度、多重PCR扩增循环数等,通过功能性试验,最终确定了最佳的反应体系。

  (三)分析性能评估

  使用三批产品在适用机型上进行了分析性能评估,包括准确度、精密度、检出限、分析特异性(交叉反应、干扰物质)等,并对核酸提取试剂盒进行了性能研究。

  1.准确度

  对 106例临床样本进行检测,采用方法学比对方式,评价本产品各靶基因变异位点的检测结果与对比方法检测结果的一致性,结果显示阴、阳性符合率均符合要求。

  2.精密度

  对10 个代表性位点(覆盖每个基因的每个外显子,包含不同变异类型)采用临床样本进行检测,结果显示本产品重复性、操作者间、日内、日间、室内、室间和再现性的精密度符合要求。

  3.检出限

  分别进行突变频率和 DNA投入量的检出限研究,采用≥95%(n=20)的阳性检出率作为接受标准,使用临床样本建立并验证了各靶基因变异位点的最低检出限,最终确定了产品检出限为:在DNA总量不低于30ng基因组DNA背景下,可检测的变异位点的最低突变频率为0.3125%~2.5%。

  4.分析特异性

  在交叉反应研究中,对常见病原菌、高浓度野生型样本、潜在的交叉反应性序列、检测范围外靶基因其它变异类型和检测范围内靶基因变异类型间的交叉反应进行研究,结果显示均不产生交叉反应。

  在干扰物质研究中,对内源性及外源性干扰物质进行评价。结果显示内源性干扰物质胆红素、甘油三酯、血红蛋白对本试剂盒不产生干扰。外源性干扰物质西妥昔单抗、厄洛替尼、甲磺酸奥希替尼、吉非替尼、氟尿嘧啶、奥沙利铂和阿莫西林对本试剂盒不产生干扰。

  5.核酸提取试剂盒的研究

  评价了不同厂家核酸提取试剂的提取性能,最终确定常州金麦格生物技术有限公司生产的核酸提取试剂(苏常械备20210011号)为本产品的核酸提取试剂。

  6.携带污染

  评价了芯片孔间交叉污染情况,结果为芯片点样及待测产品在质谱检测过程中在芯片孔间不存在交叉污染。

  (四)阳性判断值研究

  研究分为阳性判断值的建立和验证两部分。使用246例临床样本,通过受试者工作特征(ROC)曲线建立本产品的阳性判断值,使用 138例临床样本进行阳性判断值验证,最终确定阳性判断值如下:

  试剂盒检测范围内的突变位点,当 SNR≥5,且 Z-score≥7时,该突变位点检测结果为阳性;反之,当SNR<5 或Z-Score <7时,则表明该突变位点未发生突变或其突变频率低于试剂盒的检测下限。

  (五)稳定性研究

  稳定性研究包括实时稳定性、使用稳定性(开瓶和冻融稳定性)、运输稳定性和样本稳定性。

  实时稳定性研究采用三批试剂盒储存于规定储存条件下,在不同时间对试剂盒的外观、阴阳性符合率、重复性和检测限进行考察,结果显示各项性能指标均符合要求,确定试剂盒在规定的条件下(试剂盒1:-25℃~-15℃;试剂盒2:2℃~8℃)储存,有效期为5 个月。

  此外,对产品的开瓶、冻融稳定性、运输稳定性和样本稳定性分别进行了研究。结果显示,产品性能均能满足产品说明书声称。

三、临床评价概述

  申请人在中国医学科学院肿瘤医院、首都医科大学附属北京胸科医院、南京大学医学院附属鼓楼医院、河南省肿瘤医院、山西省肿瘤医院和吉林大学第一医院共 6家临床机构完成了临床试验,本次临床试验分为如下两部分。

  第一部分:采用试验体外诊断试剂与临床参考方法(一代测序)进行对比试验,评价试验体外诊断试剂的临床检测性能。

  (一)针对非小细胞肺癌适应证

  入组病例为非小细胞肺癌患者(包括腺癌、鳞癌、腺鳞癌和大细胞癌),样本类型为FFPE样本。临床试验纳入统计受试者共1484 例。

  针对EGFR基因,共检出阳性例数662例,阳性病例覆盖试验体外诊断试剂声称的各种突变,阴性 822例,试验体外诊断试剂与对比方法的阳性符合率为100%(95%CI:99.4%~100%),阴性符合率99.8%(95%CI:99.1%~99.97%)。

  针对KRAS基因,共检出阳性例数180 例,阳性病例覆盖试验体外诊断试剂声称的各种突变,阴性1304 例,试验体外诊断试剂与对比方法的阳性符合率为100%(95%CI:97.97%~100%),阴性符合率100%(95%CI:99.7%~100%)。

  针对BRAF基因,共检出阳性例数70 例,阳性病例覆盖试验体外诊断试剂声称的各种突变,阴性1414 例,试验体外诊断试剂与对比方法的阳性符合率为98.6%(95%CI :92.3%~99.96%),阴性符合率99.9%(95%CI:99.6%~100%)。

  针对ERBB2基因,共检出阳性例数66例,阳性病例覆盖试验体外诊断试剂声称的各种突变,阴性1418 例,试验体外诊断试剂与对比方法的阳性符合率为100%(95%CI:94.6%~100%),阴性符合率99.9%(95%CI:99.6%~100%)。

  针对PIK3CA基因,共检出阳性例数73 例,阳性病例覆盖试验体外诊断试剂声称的各种突变,阴性1411 例,试验体外诊断试剂与对比方法的阳性符合率为100%(95%CI:95.1%~100%),阴性符合率99.9%(95%CI:99.5%~99.9%)。

  (二)针对结直肠适应证

  入组病例为结直肠癌患者,样本类型为FFPE样本。临床试验纳入统计受试者共495 例。

  针对KRAS基因,共检出阳性例数217 例,阳性病例覆盖试验体外诊断试剂声称的各种突变,阴性 278例,试验体外诊断试剂与对比方法的阳性符合率为 99.5%(95%CI:97.5%~99.9%),阴性符合率99.3%(95%CI:97.4%~99.9%)。

  针对BRAF基因,共检出阳性例数72 例,阳性病例覆盖试验体外诊断试剂声称的各种突变,阴性 423例,试验体外诊断试剂与对比方法的阳性符合率为 100%(95%CI:95%~100%),阴性符合率100%(95%CI:99.1%~100%)。

  针对PIK3CA基因,共检出阳性例数86 例,阳性病例覆盖试验体外诊断试剂声称的各种突变,阴性 409例,试验体外诊断试剂与对比方法的阳性符合率为100%(95%CI:95.8%~100%),阴性符合率100%(95%CI:99.1%~100%)。

  第二部分:采用试验体外诊断试剂与原研伴随诊断试剂进行比较研究,评价试验体外诊断试剂的伴随诊断性能。

  (一)针对非小细胞肺癌适应证

  入组病例均为非小细胞肺癌患者,主要为药物临床试验适应证人群,样本类型为FFPE样本。

  针对EGFR基因,共纳入有效样本467例,阳性病例346例,阳性病例覆盖试验体外诊断试剂声称的各种伴随位点,阴性病例 121例,试验体外诊断试剂与原研伴随诊断试剂的阳性符 合 率99.4%(95%CI: 97.9% ~ 99.9%), 阴 性 符 合 率98.3%(95%CI:94.2%~99.8%)。

  (二)针对结直肠癌适应证

  入组病例均为结直肠癌患者,主要为药物临床试验适应证人群,样本类型为FFPE样本。

  针对KRAS基因,共纳入有效样本242例,阳性病例 153例,阳性病例覆盖试验体外诊断试剂声称的各种伴随位点,阴性病例89 例,试验体外诊断试剂与原研伴随诊断试剂的阳性符合率99.3%(95%CI:96.4%~99.98%),阴性符合率98.9%(95%CI:93.9%~99.9%)。

  综上所述,该产品临床试验设计符合《体外诊断试剂临床试验技术指导原则》的相关要求。临床试验结果显示该产品临床性能满足临床要求。

四、产品受益风险判定

  根据GB/T 42062-2022《医疗器械-风险管理对医疗器械的应用》对产品进行风险分析。

  (一)受益评估

  本试剂盒用于体外定性检测非小细胞肺癌(NSCLC)、结直肠癌(CRC)患者经福尔马林固定的石蜡包埋(FFPE)组织样本中EGFR、KRAS、PIK3CA、BRAF和ERBB2 基因变异。针对NSCLC,EGFR基因19号外显子缺失(19del)和L858R点突变用于盐酸厄洛替尼片和甲磺酸奥希替尼片的伴随诊断检测,EGFR基因T790M点突变用于甲磺酸奥希替尼片的伴随诊断。针对CRC,KRAS基因野生型用于西妥昔单抗注射液的伴随诊断检测。本试剂盒所能检测的其他基因突变位点未经伴随诊断验证。

  本产品临床应用的主要受益在于:可以作为盐酸厄洛替尼片、甲磺酸奥希替尼片的伴随诊断试剂对靶向用药人群进行筛选,从而让NSCLC患者获得及时的治疗;可以作为西妥昔单抗注射液的伴随诊断试剂对靶向用药人群进行筛选,从而让CRC患者获得及时的治疗。

  (二)风险评估

  对已知危险(源)进行风险评价,按照风险可接受准则判断每个危险(源)的风险是否达到可接受水平,对合理可降低的风险、不经过风险/收益分析即判定为不可接受的风险采取控制措施,并对具体措施实施验证,同时重新对采取措施后的风险进行估计,确认其风险水平是否可接受。但为保证用械安全,基于对主要剩余风险的规避,需要在说明书中提示以下信息:

  本试剂盒仅用于对NSCLC和CRC患者靶基因序列的检测,其检测结果仅供临床参考,不应作为患者个体化治疗的唯一依据,临床医生应结合患者病情及其他实验室检测指标等因素对检测结果进行综合判断。

  警示及注意事项:产品说明中介绍了该产品检验方法的局限性及使用中的注意事项。

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